Afin de garantir une plus grande efficacité, la coordination de la planification écologique est confiée au ​​Secrétariat général à la planification écologique (SGPE). Sur décision du Conseil des Ministres du 10 septembre 2026, Vincent Tejedor, ingénieur en chef des mines et chef du "Pôle vert" au sein du cabinet du Premier ministre, a été nommé Secrétaire général à la planification écologique.

Le SGPE a pour mission d’assurer la cohérence et le suivi des politiques à visée écologique, d’initier et de cadrer la mobilisation des ministères et parties prenantes, de coordonner toutes les négociations et enfin de mesurer la performance des actions menées. 

L'équipe du Secrétariat général à la planification écologique (SGPE) est pluridisciplinaire et regroupe à ce jour des agents aux expertises complémentaires (ingénieurs, experts des questions environnementales, financières et économiques et spécialistes de la mobilisation). Le SGPE est organisé en 4 pôles sectoriels :

• Le pôle « Agriculture, biodiversité et économie circulaire » est chargé des politiques publiques concernant l’ensemble de nos ressources naturelles. Les membres de cette équipe appuient notamment les travaux concernant la gestion durable de la forêt, de nos ressources en eau, de nos sols, la transition écologique de l’agriculture, la restauration et la protection de la biodiversité, la mise en cohérence de nos trajectoires (bouclage biomasse, eau...). La thématique alimentation et consommation infuse également ses travaux, pour faire pivoter les modes de vie des Français vers des pratiques plus durables en la matière.
• Le pôle « Décarbonation & Énergie » est chargé des politiques publiques relatives à la décarbonation de nos infrastructures industrielles et énergétiques, du transport de voyageurs et de marchandises, ainsi que des bâtiments résidentiels et tertiaires. Cette équipe dispose également d'une expertise relative aux mécanismes de financement de la transition (suivi et alignement du PLF avec les objectifs de planification écologique notamment).  
• Le pôle « Territorialisation et adaptation » a la charge de porter la planification écologique au plus près des territoires (collectivités territoriales et acteurs locaux), en pilotant une démarche à la maille régionale et infrarégionale. L’équipe et l’administration territoriale de l’Etat accompagnent les collectivités à la construction et au pilotage de leur feuille de route. Cette équipe a notamment élaboré et mis en œuvre la méthode des COP régionales  ainsi que le dispositif des “Ateliers des maires”, permettant d’organiser le partage des priorités de l’Etat en matière de planification écologique auprès des nouveaux maires. Elle a par ailleurs en charge le suivi des politiques d’adaptation et du PNACC, en s’appuyant sur l’expertise sectorielle des autres pôles.  
• Le pôle « Numérique et Données » met les outils numériques et la donnée au service de la transition écologique, selon les axes du référentiel d'actions Numériques et Données de la planification écologique publié en novembre 2023 et mis à jour en 2025. Cette équipe coordonne la démarche d'urbanisation des systèmes d'information pour maximiser l'effet de levier du numérique au service de la planification écologique. Elle est aussi chargée d'implémenter le baromètre de la planification écologique dans une démarche intégrée de suivi et de pilotage des politiques publiques environnementales.